Les chancres sur les plantes peuvent être causés par divers champignons et bactéries phytopathogènes. Parmi les champignons les plus fréquemment impliqués figurent *Nectria spp.*, *Cytospora spp.* et *Botryosphaeria spp.*, tandis que parmi les bactéries, *Pseudomonas syringae* et *Erwinia amylovora* se distinguent. Ces organismes s'établissent dans les tissus ligneux par le biais de blessures, d'élagages ou de fissures naturelles. Une fois pénétrés, ils commencent à se multiplier localement, affectant les cellules vivantes et détruisant les tissus en libérant des toxines ou des enzymes dégradantes. Les champignons forment généralement des structures de résistance telles que des spores, qui restent viables pendant de longues périodes dans les restes végétaux ou dans le sol. Lorsque les conditions environnementales sont favorables (températures tempérées et humidité élevée), ces structures germent et produisent du mycélium qui se propage à travers les tissus internes, provoquant une nécrose. Dans le cas des bactéries, elles se propagent rapidement par le biais d’éclaboussures d’eau ou d’outils contaminés, colonisant les tissus vasculaires et provoquant l’effondrement des cellules. L’infection se perpétue avec de nouveaux cycles de propagation à partir de chancres actifs ou latents.