L'agent pathogène Erwinia amylovora est une bactérie à Gram négatif qui provoque le feu bactérien dans les arbres fruitiers à pépins. Cette bactérie survit l'hiver en marge des chancres formés sur les branches et les troncs infectés. Avec l’arrivée du printemps et la hausse des températures, les bactéries commencent à exsuder un liquide collant rempli de cellules bactériennes, qui est transporté vers de nouvelles fleurs, bourgeons et feuilles par les insectes, la pluie et les outils de taille contaminés. Erwinia amylovora infecte les tissus végétaux par le biais de blessures naturelles ou provoquées, telles que celles causées par des insectes ou des outils. Une fois à l’intérieur de la plante, les bactéries se multiplient rapidement, obstruant les vaisseaux conducteurs de la sève et produisant des toxines qui tuent les cellules végétales. Pendant l’été, les bactéries peuvent se propager davantage et infecter de nouvelles pousses et de nouveaux fruits. À la fin de la saison, les bactéries retournent sur les chancres pour hiberner et répéter le processus l'année suivante.